Vazyme轉座酶建庫產品登上CELL
2018年12月13日,國際頂級學術期刊《Cell》雜誌刊登了來自中國科學院動物研究所周琪課題組與李偉課題組題為Asymmetric Expression of LincGET Biases Cell Fate in Two-Cell Mouse Embryos的合作研究論文,該研究對LincGET (內源反轉錄病毒相關的長非編碼RNA)在早期細胞命運決定中的作用及詳細機制進行了深入探索。
研究發現LincGET的表現程度在小鼠2-細胞期和4-細胞期的各個卵裂球之間是不均等的。通過顯微注射的方法在2-細胞胚胎的一個卵裂球中過表達LincGET,能使該卵裂球的子細胞選擇內細胞團(inner cell mass, ICM)命運。進一步的機制研究顯示,LincGET與CARM1(Coactivator-associated arginine methyltransferase 1, H3特定的精氨酸甲基轉移酶)形成複合體,偏好性地結合轉座序列,建立激活型染色質修飾H3R26me2 (組蛋白H3精氨酸26位點的一甲基化),增加全基因組染色質的開放程度,提高多能性相關基因的表現程度,從而促使具有更高LincGET表現程度的胚胎細胞傾向於選擇ICM命運。該工作首次將小鼠第一次細胞命運分化的選擇提前至2-細胞胚胎時期,並發現其關鍵分子是一個內源反轉錄病毒相關的長非編碼RNA。這將為探索早期胚胎的全能性調控以及第一次細胞命運分化機理奠定重要基礎,並為建立更高多能性甚至全能性的幹細胞提供了新的理論參考。
Vazyme的TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina(TD501/TD502/TD503)轉座酶建庫試劑盒助力該項研究。TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina 具有高效便捷的特點,可在DNA水平上捕獲特定時空狀態下基因組中所有活躍轉錄的調控序列,對轉座酶可接近性核染色質區域進行測序分析,驗證染色質的可及性與轉錄調控的關係,進一步瞭解特定時空下的基因調控網絡。在該研究中,使用Vazyme的 TD502 對收集的8-細胞期胚胎進行ATAC-seq,結果顯示,ICM特異性基因的啟動子序列在LincGET或Carm1過表達的卵裂球中更加開放,而在對照卵裂球中,TE啟動子區域的染色質相對保守。這成為證明LincGET和CARM1通過增加染色質開放性並激活ICM特異性基因來促使胚胎細胞傾向於選擇ICM命運的強有力證據之一,對幹細胞與生殖生物學的研究上有很大的幫助!
---------------產品資訊-----------------
TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina
TD501/TD502/TD503
● 快速便捷的建庫流程
和傳統文庫構建方法相比,TruePrep 試劑盒採用新型的轉座酶法進行 DNA 片段化,將繁瑣的 DNA 片段化、末端修復和接頭連接反應等步驟簡化為一步 10 min 的酶促反應。也就是說,單個樣品建庫時間少於 90 min!
● 樣本範本需求量低
DNA 樣本量最低僅需1 ng,即可構建出高品質文庫。
● 多種規格自由選擇
根據DNA起始量不同分別提供50 ng、5 ng、1 ng三種規格的試劑盒,可根據實驗類型自由選擇。
● 更高的建庫通量
提供單端96種、雙端96種、雙端384種的多種index組合,快速簡便的操作使得單人單日可以達到96個文庫的建庫通量,適用於自動化建庫平臺。
● 極高的擴增文庫品質
含文庫擴增專用聚合酶,配以精心優化的反應緩衝,最大程度上保證了文庫擴增的高效性和均一性。
2018年12月13日,國際頂級學術期刊《Cell》雜誌刊登了來自中國科學院動物研究所周琪課題組與李偉課題組題為Asymmetric Expression of LincGET Biases Cell Fate in Two-Cell Mouse Embryos的合作研究論文,該研究對LincGET (內源反轉錄病毒相關的長非編碼RNA)在早期細胞命運決定中的作用及詳細機制進行了深入探索。
研究發現LincGET的表現程度在小鼠2-細胞期和4-細胞期的各個卵裂球之間是不均等的。通過顯微注射的方法在2-細胞胚胎的一個卵裂球中過表達LincGET,能使該卵裂球的子細胞選擇內細胞團(inner cell mass, ICM)命運。進一步的機制研究顯示,LincGET與CARM1(Coactivator-associated arginine methyltransferase 1, H3特定的精氨酸甲基轉移酶)形成複合體,偏好性地結合轉座序列,建立激活型染色質修飾H3R26me2 (組蛋白H3精氨酸26位點的一甲基化),增加全基因組染色質的開放程度,提高多能性相關基因的表現程度,從而促使具有更高LincGET表現程度的胚胎細胞傾向於選擇ICM命運。該工作首次將小鼠第一次細胞命運分化的選擇提前至2-細胞胚胎時期,並發現其關鍵分子是一個內源反轉錄病毒相關的長非編碼RNA。這將為探索早期胚胎的全能性調控以及第一次細胞命運分化機理奠定重要基礎,並為建立更高多能性甚至全能性的幹細胞提供了新的理論參考。
Vazyme的TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina(TD501/TD502/TD503)轉座酶建庫試劑盒助力該項研究。TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina 具有高效便捷的特點,可在DNA水平上捕獲特定時空狀態下基因組中所有活躍轉錄的調控序列,對轉座酶可接近性核染色質區域進行測序分析,驗證染色質的可及性與轉錄調控的關係,進一步瞭解特定時空下的基因調控網絡。在該研究中,使用Vazyme的 TD502 對收集的8-細胞期胚胎進行ATAC-seq,結果顯示,ICM特異性基因的啟動子序列在LincGET或Carm1過表達的卵裂球中更加開放,而在對照卵裂球中,TE啟動子區域的染色質相對保守。這成為證明LincGET和CARM1通過增加染色質開放性並激活ICM特異性基因來促使胚胎細胞傾向於選擇ICM命運的強有力證據之一,對幹細胞與生殖生物學的研究上有很大的幫助!
---------------產品資訊-----------------
TruePrep DNA Library Prep Kit V2 for Illumina
TD501/TD502/TD503
● 快速便捷的建庫流程
和傳統文庫構建方法相比,TruePrep 試劑盒採用新型的轉座酶法進行 DNA 片段化,將繁瑣的 DNA 片段化、末端修復和接頭連接反應等步驟簡化為一步 10 min 的酶促反應。也就是說,單個樣品建庫時間少於 90 min!
● 樣本範本需求量低
DNA 樣本量最低僅需1 ng,即可構建出高品質文庫。
● 多種規格自由選擇
根據DNA起始量不同分別提供50 ng、5 ng、1 ng三種規格的試劑盒,可根據實驗類型自由選擇。
● 更高的建庫通量
提供單端96種、雙端96種、雙端384種的多種index組合,快速簡便的操作使得單人單日可以達到96個文庫的建庫通量,適用於自動化建庫平臺。
● 極高的擴增文庫品質
含文庫擴增專用聚合酶,配以精心優化的反應緩衝,最大程度上保證了文庫擴增的高效性和均一性。