(NR603) VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina
NR603
| PN | Product Name | Size | Price (TWD) |
| NR603-01 | VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina |
24 rxn | Inquiry |
| NR603-02 | VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina |
96 rxn | Inquiry |
本試劑盒適合於針對mRNA和所有除rRNA以外的非編碼RNA的鏈特異性RNA-seq分析，包括基因表達、單核苷酸變異 (single nucleotide variation)，可變剪切/融合基因、目標轉錄組分析等。
優勢
• 包含Ribo-OffTM rRNA depletion module， 可去除人、小鼠、大鼠、牛、狗、馬、雞、猴、豬、斑馬魚等物種的核糖體RNA
• 鏈特異性建庫
• 優化的大片段建庫方案
說明
VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina適用於起始模板為0.1-1 μg的人、小鼠、 大鼠總RNA的鏈特異性轉錄組文庫構建。與常規mRNA-seq文庫構建不同的是，本試劑盒將rRNA (包括細胞質28S, 18S, 5S rRNA以及線粒體12S, 5.8S rRNA)從總RNA中去除，保留mRNA以及其它非編碼RNA，可用於lncRNA等非編碼RNA的分析。降解的RNA樣本也可用本試劑盒進行文庫構建。 在第二鏈cDNA合成時，摻入dUTP標記第二鏈； PCR前將標記的第二鏈模板用UDG酶消化，使得最終的測序信息都來自於第一鏈cDNA，從而保留了RNA的鏈方向性。定序後的數據分析可確定轉錄本是來自正義還是反義DNA鏈。
實驗案例
圖1. Ribo-Off模組去除rRNA原理示意圖。
圖2. 使用Ribo-Off模組去除rRNA總共耗時不超過2小時，其中操作時間僅需10分鐘以內。
圖3. 1 μg universal human reference RNA分別用Oligo dT磁珠純化mRNA或者用Ribo-Off模組去除rRNA後構建文庫，用Hiseq 2500測序。數據與人類基因組數據庫hg19進行比對。可以看到， Ribo-Off模組可以更有效地去除rRNA，並可保留更多的非編碼RNA信息。
期刊發表
He YM, Li X, Perego M, et al. Transitory presence of myeloid-derived suppressor cells in neonates is critical for control of inflammation. Nature medicine. 2018 IF: 29.886 更多資訊
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圖2. 使用Ribo-Off模組去除rRNA總共耗時不超過2小時，其中操作時間僅需10分鐘以內。
圖3. 1 μg universal human reference RNA分別用Oligo dT磁珠純化mRNA或者用Ribo-Off模組去除rRNA後構建文庫，用Hiseq 2500測序。數據與人類基因組數據庫hg19進行比對。可以看到， Ribo-Off模組可以更有效地去除rRNA，並可保留更多的非編碼RNA信息。
期刊發表
He YM, Li X, Perego M, et al. Transitory presence of myeloid-derived suppressor cells in neonates is critical for control of inflammation. Nature medicine. 2018 IF: 29.886 更多資訊
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