VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina v2
NR612
| PN | Product Name | Size | Price (TWD) |
| NR612-01 | VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina |
24 rxn | 78,645 |
| NR612-02 | VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina |
96 rxn | 253,050 |
• 鏈特異性文庫：保留轉錄的方向性
• 最優化的反應體系：物種類型相容廣
• 更寬範本相容範圍：RNA起始量可低至50 ng
• 極簡的建庫流程：一天完成文庫構建及質檢
說明
VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina v2是針對Illumina高通量測序平臺定向開發的鏈特異性轉錄組文庫構建專用試劑盒。本試劑盒適用於起始範本量為0.05-4 μg完整度良好的動、植物及真菌等真核生物的總RNA的鏈特異轉錄組文庫構建，與常規轉錄組建庫不同的是在第二鏈合成時底物摻入了dUTP，並在PCR擴增富集文庫前將帶U標記的第二鏈範本用UDG酶消化，確保了最終的測序資訊都來自於第一鏈cDNA，從而保留了mRNA的鏈方向性，後期資料分析可確定轉錄本是來自DNA的正義還是反義鏈。
本試劑盒是利用磁珠分選的方式，可以快速獲得特定長度的文庫，滿足不同實驗的個性化需求。
本試劑盒是利用磁珠分選的方式，可以快速獲得特定長度的文庫，滿足不同實驗的個性化需求。
實驗案例
表1.以1μg的293T細胞總RNA起始，分別以VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2（vazyme#NR612），N，K，A公司的鏈特異性mRNA試劑盒構建文庫，質控後的文庫用illumina Hiseq X ten PE150測序，從基本的下機資料上看A公司的文庫接頭殘餘率高達37%且基因檢出數明顯偏低，vayme，N，K三個公司的在基因檢出數及其他各項指標上表現較一致。
圖1.以1 μg的293T細胞總RNA起始，分別以VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2（Vazyme#NR612），N，K，A公司的鏈特異性mRNA試劑盒構建文庫,從圖中可看出NR612，N，K，A四款RNA建庫試劑盒的文庫均一性都較高，沒有5’或3’的偏好性。
圖2. 將NR612，N，K，A 的下機資料比對到人參考基因組上的Reads 進行統計，從圖中可看出Vazyme，N，A 比對到exon，utr，intronic，intergenic 區域的總Reads 數基本一致，K 文庫比對exon 區域的資料占比偏低且比對到intronic 區的數據偏高。
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