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(NR612) VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina v2

NR612
 
        
 
PN Product Name Size Price (TWD)
NR612-01 VAHTS Stranded mRNA-seq
Library Prep Kit for Illumina
24 rxn Inquiry
NR612-02 VAHTS Stranded mRNA-seq
Library Prep Kit for Illumina
96 rxn Inquiry
 

 
   優勢    
• 鏈特異性文庫:保留轉錄的方向性
• 最優化的反應體系:物種類型相容廣
• 更寬範本相容範圍:RNA起始量可低至50 ng
• 極簡的建庫流程:一天完成文庫構建及質檢

   說明      
VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina v2是針對Illumina高通量測序平臺定向開發的鏈特異性轉錄組文庫構建專用試劑盒。本試劑盒適用於起始範本量為0.05-4 μg完整度良好的動、植物及真菌等真核生物的總RNA的鏈特異轉錄組文庫構建,與常規轉錄組建庫不同的是在第二鏈合成時底物摻入了dUTP,並在PCR擴增富集文庫前將帶U標記的第二鏈範本用UDG酶消化,確保了最終的測序資訊都來自於第一鏈cDNA,從而保留了mRNA的鏈方向性,後期資料分析可確定轉錄本是來自DNA的正義還是反義鏈。
本試劑盒是利用磁珠分選的方式,可以快速獲得特定長度的文庫,滿足不同實驗的個性化需求。
 

   實驗案例    

表1.以1μg的293T細胞總RNA起始,分別以VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2(vazyme#NR612),N,K,A公司的鏈特異性mRNA試劑盒構建文庫,質控後的文庫用illumina Hiseq X ten PE150測序,從基本的下機資料上看A公司的文庫接頭殘餘率高達37%且基因檢出數明顯偏低,vayme,N,K三個公司的在基因檢出數及其他各項指標上表現較一致。



圖1.以1 μg的293T細胞總RNA起始,分別以VAHTS Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina V2(Vazyme#NR612),N,K,A公司的鏈特異性mRNA試劑盒構建文庫,從圖中可看出NR612,N,K,A四款RNA建庫試劑盒的文庫均一性都較高,沒有5’或3’的偏好性。

圖2. 將NR612,N,K,A 的下機資料比對到人參考基因組上的Reads 進行統計,從圖中可看出Vazyme,N,A 比對到exon,utr,intronic,intergenic 區域的總Reads 數基本一致,K 文庫比對exon 區域的資料占比偏低且比對到intronic 區的數據偏高。


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