VAHTS Serum/Plasma Circulating DNA Kit
N902
| PN | Product Name | Size | Price (TWD) |
| N902-01 |
VAHTS Serum/Plasma
Circulating DNA Kit |
50 rxns | 10,080 |
| N902-02 |
VAHTS Serum/Plasma
Circulating DNA Kit |
200 rxns | 35,490 |
優勢
保存條件:
溶解後的Protease K需保存於-20 ℃
● 適用於短片段cfDNA純化
● 純化純度高，產量高，產物濃度測定準確
● 純化cfDNA覆蓋度好，無偏好性，適於次世代序(NGS)用建庫實驗
● 兼容手動純化及自動純化程序
說明
VAHTS Serum/Plasma Circulating DNA Kit為基於超順磁性的磁珠純化技術，針對血清/血漿樣本中短片段游離DNA富集定向優化的DNA純化試劑盒。超順磁性氧化矽納米磁珠具有分散度高、表面積大、吸附特異性好等特點，高效結合併富集DNA片段。
本試劑盒應用於從較靈活起始範圍（200 μl~2 ml）的血清、血漿樣品中提取高質量游離DNA，操作簡單、快速，全程無有毒有機溶劑。針對低分子量核酸定向優化，具有DNA提取無偏好性、提取產量高、核酸純度高、重複性強等優點。得到的DNA可直接用於定量PCR和二代定序等實驗。兼容手動純化和自動純化流程，同時兼容無游離醛基的cfDNA採血管如Streck Cell-Free DNA BCT或VAHTSTM 游離DNA保存用採血管或普通EDTA採血管得到的血漿樣本。
本試劑盒應用於從較靈活起始範圍（200 μl~2 ml）的血清、血漿樣品中提取高質量游離DNA，操作簡單、快速，全程無有毒有機溶劑。針對低分子量核酸定向優化，具有DNA提取無偏好性、提取產量高、核酸純度高、重複性強等優點。得到的DNA可直接用於定量PCR和二代定序等實驗。兼容手動純化和自動純化流程，同時兼容無游離醛基的cfDNA採血管如Streck Cell-Free DNA BCT或VAHTSTM 游離DNA保存用採血管或普通EDTA採血管得到的血漿樣本。
實驗範例
人cfDNA為平均長度180 bp的短片段DNA，因此對較小的DNA片段回收率是cfDNA純化效率的關鍵因素。使用VAHTS磁珠法血漿游離DNA純化試劑盒中的磁珠純化DNA ladder（70-1000 bp區間），與原始DNA以相同稀釋倍數經Agilent 2100 DNA1000晶片檢測如下圖所示，純化後的DNA與投入DNA重合度高，無DNA片段大小差異。
純化濃度高
使用VAHTS磁珠法血漿游離DNA純化試劑盒純化血漿cfDNA，經Agilent 2100高敏晶片檢測，線條平滑，cfDNA峰型飽滿，其它位置無雜峰，顯示純化的cfDNA濃度高，雜質少。使用純化的cfDNA適合用於次世代定序(NGS)的建庫實驗，建庫產量高。
純化產量高
與傳統Column純化同一血漿樣本的游離DNA，經Qubit（Thermo Fisher）測定濃度，VAHTS 磁珠純化產量少於Column純化產物，但經qPCR檢測血漿中的短片段外源DNA相對量的比例，VAHTS磁珠純化的產量是Q Column純化的1.5倍左右，T Column純化的3倍以上，說明受Carrier RNA影響，通過Qubit測定的濃度不能反映實際cfDNA濃度，VAHTS磁珠法純化試劑盒實際純化效率高於傳統Column純化方式。
純化DNA濃度精確
傳統柱純化法受到Carrier RNA加入的影響，測定濃度時比實際值偏大，影響後續操作判斷。VAHTS磁珠法提取的cfDNA濃度準確，用Qubit試劑盒定量及用KAPA gDNA絶對定量試劑盒（KAPA hgDNA Quantification and QC Kit）做QPCR的定量結果吻合度高。
兼容手動及自動純化程序
手動純化最大樣本量可達16樣/次，操作時間<2小時/次。由於磁珠法無需離心換管等操作，因此同樣可適用於自動核酸純化儀，可針對不同樣品量及樣品來源設定不同處理程度，簡單、快速的進行大規模提取，大大降低實驗者的工作量和實驗中的人為誤差，保證結果的穩定性和均一性。
cfDNA構建文庫覆蓋度好, 無GC偏好性
使用VAHTS磁珠法血漿游離DNA提純化劑盒提取cfDNA，1ng投入建庫進行定序分析。定序平台為X-Ten，cfDNA PCR文庫定序數據顯示GC含量正常，沒有偏好性；Q30在90%以上，說明定序數據質量較好；因cfDNA屬於高度片段化狀態，覆蓋度在60-70%，屬於正常範圍；dup rate普遍較高，和定序平台有關；數據顯示幾乎沒有接頭殘留。
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