轉錄組_環狀RNA定序 (CircRNA-seq)

　
Circ RNA Sequencing
 
環狀RNA（circRNA）是區別於傳統線性RNA的一類新型RNA，呈閉合環狀，不具有Poly A結構，大量存在於真核轉錄組中。大部分的環狀RNA由外顯子序列構成，屬於非編碼RNA，在不同的物種中具有保守性，同時存在時空表達特異性。由於環狀RNA對核酸酶不敏感，所以比線性RNA更穩定，這使得環狀RNA在作為新型臨床診斷標記物的開發應用上具有明顯優勢。除此之外，環狀RNA還具有以下功能：
 
A. 充當miRNA海綿，吸附miRNA
B. 調節自身基因mRNA的表達
C. 與RNA結合蛋白相互作用，調控其他RNA
D. 部分環狀RNA可以直接翻譯成蛋白質
 
  技術流程  
 
       

  生物訊息分析   
 
1、數據統計
2、基因比對與統計
3、環狀RNA鑑定
4、環狀RNA分佈統計
5、環狀RNA註釋
6、環狀RNA表達量計算
7、樣品組間表達差異分析
8、差異基因GO分析
9、差異基因KEGG分析
10、生物學重複樣品間相關性分析
11、環狀RNA序列預測
12、CircRNA-miRNA目標預測
13、CircRNA-miRNA網絡構建

  報告內容範例   

1. circRNA預測及數目統計


2. circRNA表達定量及差異分析


3. circRNA關聯基因的GO富集散點圖


4. circRNA關聯基因的KEGG富集散點圖

5. circRNA-miRNA靶向預測及網絡構建

 
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