全基因組甲基化定序 (Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS)

　
Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS
 
 甲基化分析服務
統計分析 1000 / sample
*2組以上 多組比較(>20) 3000 / group
*客製化需求
　
 

 
DNA甲基化是表觀遺傳學（Epigenetics）的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要的作用。全基因組甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS），其採用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA使未甲基化修飾的胞嘧啶C轉化為尿嘧啶U，通過對處理後的DNA進行全基因組重測序，並與參考基因組進行比對，從基因組水平實現單鹼基分辨率的、高精確度甲基化水平分析。

  應用領域  

廣泛應用於細胞分化、組織發育等基礎機制研究，以及動植物育種、人類健康與疾病治療等研究領域。​
 

  技術優勢  

●  檢測精度高：單鹼基分辨率，精確分析每一個C鹼基的甲基化狀態；
●  檢測範圍廣：借助高通量測序平台，對全基因組範圍內甲基化區域進行研究；
●  可靠性高：直接對甲基化片段進行測序和定量，無交叉反應和背景噪音；
●  性價比高：相比傳統PCR+Sanger測序方法，使用抗體富集高甲基化區域測序，費用少。


  生物訊息分析  


 

  報告內容範例  

全基因組甲基化測序發現人類特有的差異甲基化區域
研究人對人類和黑猩猩、大猩猩、猩猩等非人類靈長類動物的全血DNA採用HiSeq2000的100PE策略進行了全基因組甲基化測序，鑑定了數百個差異甲基化區域，其中25%的區域在人類的組織中被檢測到。在人類特異性低甲基化中，發現了一個重要的超過內源性逆轉錄病毒分子。本文首次報導了種間遺傳和表觀在不完整的譜系分類中兩者之間、轉錄因子結合位點與人類差異甲基化區域變化的親密關係。而在人類差異甲基化的轉錄因子結合位點中，本文觀察了超人類特異性代替物，表明調整主要物質的改變是構成某些人類特異性甲基化模式的基礎。本文還發現在人類譜系中，DNA甲基化的採集經常在這些CpG位點附近的鶴崗蘇水平中式雙倍加速進化的。本文研究結果揭示人類甲基化模式常規觀點的新見解和物種間非編碼變異的說明。


人類（Differentially methylated regions，DMRs）的特徵
A：與背景組中的TFBS相比，DMR內的TFBS中的人類特異性替換增加。
保守的結合位點（灰色）和具有人類特異性變化的結合位點（橙色）；
B：與ERV元件重疊的CpG位點的分數；
C：人類低甲基化和高甲基化DMR的分佈；
D：在人類低DMRs和高DMRs組蛋白修飾富集。

Hernando-Herraez I, Heyn H, et al., The interplay between DNA methylation and sequence divergence in recent human evolution. Nucleic Acids Res. 2015, 43(17):8204-14.
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