轉錄組_小RNA定序 (Small RNA-seq)
Small RNA Sequencing
技術優勢
● 通量高：一次測序得到1000萬條以上的序列
● 高分辨率：可檢測small RNA單個鹼基差異
● 高精準度：從幾個到數十萬個拷貝精確計數
● 運用範圍廣：可與基因表達譜定序或者轉錄組定序等結合使用，以便從多角度同時解釋相關生理過程
● 良好的重複性：深度定序保證了抽樣的隨機性，重複性非常好，無需技術重複
技術流程
生物訊息分析
送樣要求
1. 樣品類型：細胞、新鮮組織或RNA樣品
2. 樣品需求量：細胞樣品≥1×10E7，動物組織≥1g，植物組織≥2g，總RNA≥10 μg
3. 樣品濃度：RNA樣品≥100 ng/μl
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Small RNA分析服務
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| 統計分析 | 1000 / 樣本 |
| *2組以上 多組比較(>20) | 3000 / group |
| *客製化需求 |
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Small RNA是生物體內一類重要的調節分子，長度在18-30nt之間，主要包括miRNA、siRNA和piRNA。它的功能主要是誘導基因沉默，參與調控基因表達、生長發育、非生物脅迫和病原菌的侵害等過程。小RNA定序(Small RNA Sequencing)利用高通量定序技術，研究特定組織在特定狀態下的所有已知small RNA，也可發現物種或組織特異small RNA 並預測其目標基因，為研究small RNA 的功能及基因調控機制提供了有力工具。
技術優勢
● 通量高：一次測序得到1000萬條以上的序列
● 高分辨率：可檢測small RNA單個鹼基差異
● 高精準度：從幾個到數十萬個拷貝精確計數
● 運用範圍廣：可與基因表達譜定序或者轉錄組定序等結合使用，以便從多角度同時解釋相關生理過程
● 良好的重複性：深度定序保證了抽樣的隨機性，重複性非常好，無需技術重複
生物訊息分析
標準訊息分析
數據產出統計，對原始定序數據去接頭污染，去低質量 reads
15-30nt small RNA 定序結果的長度分佈
已知miRNA 的表達譜構建
按照優先級將 small RNA 進行分類註釋
已知 miRNA靶基因預測
已知 miRNA靶基因GO註釋和KEGG
已知 miRNA 差異分析（2個或 2個以上樣品）和聚類分析（3 個或 3個以上樣品)
差異 miRNA 靶基因預測（需要提供基因編碼序列，2 個或2個以上樣品）
差異miRNA 靶基因GO 註釋和KEGG 通路分析 （2 個或2個以上樣品）
報告內容範本
數據產出統計，對原始定序數據去接頭污染，去低質量 reads
15-30nt small RNA 定序結果的長度分佈
已知miRNA 的表達譜構建
按照優先級將 small RNA 進行分類註釋
已知 miRNA靶基因預測
已知 miRNA靶基因GO註釋和KEGG
已知 miRNA 差異分析（2個或 2個以上樣品）和聚類分析（3 個或 3個以上樣品)
差異 miRNA 靶基因預測（需要提供基因編碼序列，2 個或2個以上樣品）
差異miRNA 靶基因GO 註釋和KEGG 通路分析 （2 個或2個以上樣品）
報告內容範本
送樣要求
1. 樣品類型：細胞、新鮮組織或RNA樣品
2. 樣品需求量：細胞樣品≥1×10E7，動物組織≥1g，植物組織≥2g，總RNA≥10 μg
3. 樣品濃度：RNA樣品≥100 ng/μl