DNA甲基化分析-qPCR HRM法
SNP/ 單核苷酸多態性分析
說明
SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即單核苷酸多態性,是由於單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態。一般來說,一個 SNP 位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP 在人類基因組中的發生頻率比較高,大約平均每 1000 個鹼基中就有一個多態位點。有些 SNP 位點還會影響基因的功能,導致生物性狀改變甚至致病。單核苷酸多態性是研究人類家族和動植物品系遺傳變異的重要依據,因此被廣泛用於群體遺傳學研究 (如生物的起源、進化及遷移等方面) 和疾病相關基因的研究,在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。
HRM法
原理
高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的 SNP 研究工具,它通過實時監測升溫過程中雙鏈 DNA 螢光染料與 PCR 擴增產物的結合情況,來判斷是否存在 SNP,而且不同 SNP 位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形,因此 HRM 分析能夠有效區分不同 SNP 位點與不同基因型。這種檢測方法不受突變鹼基位點與類型的侷限,無需序列特異性探針,在 PCR 結束後直接運行高分辨率熔解,即可完成對樣品基因型的分析。該方法無需設計探針,操作簡便、快速,成本低,結果準確。
--為進行分析 PCR 產物中基因突變的方法。
-- 利用高溫作用將DNA解離後,由溫度變化進行偵測螢光的降解率,再依據核酸長度、GC 含量、GC 分布及雙股的互補性,即可快速完成對樣本間的區分。
應用
HRM法
原理
高分辨率熔解曲線分析(HRM)是近幾年興起的 SNP 研究工具,它通過實時監測升溫過程中雙鏈 DNA 螢光染料與 PCR 擴增產物的結合情況,來判斷是否存在 SNP,而且不同 SNP 位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形,因此 HRM 分析能夠有效區分不同 SNP 位點與不同基因型。這種檢測方法不受突變鹼基位點與類型的侷限,無需序列特異性探針,在 PCR 結束後直接運行高分辨率熔解,即可完成對樣品基因型的分析。該方法無需設計探針,操作簡便、快速,成本低,結果準確。
--為進行分析 PCR 產物中基因突變的方法。
-- 利用高溫作用將DNA解離後,由溫度變化進行偵測螢光的降解率,再依據核酸長度、GC 含量、GC 分布及雙股的互補性,即可快速完成對樣本間的區分。
應用
- 單核苷酸多型性(single-nucleotide polymorphism, SNP)分析。
- 基因分型 ( Genotyping ) 分析。
- 基因突變 ( Mutation ) 研究。
- 基因甲基化 ( Methylation ) 研究。
- 客製化實驗分析服務
. 包括核酸純化服務
. 客製化實驗特定基因片段HRM引子設計- 分型結果報告
應用實例1
甲基化應用
應用實例2
基因型別判定
應用實例3
基因缺失(gene deletion)分析
甲基化應用
應用實例2
基因型別判定
應用實例3
基因缺失(gene deletion)分析
注意事項
* 所需樣品種類:細胞株,動物組織類,植物組織類等等。
* 樣品須為非感染性生物。
* 為了避免樣本RNA degradation,可採下列方式處理檢體:
1. 1份樣本體積與4份RNA Keeper Tissue Stabilizer 均質混合,可穩定保存於4度C一周內。
2. 血液樣本以3倍體積加入RBC Lysis Buffer。
* 樣品須為非感染性生物。
* 為了避免樣本RNA degradation,可採下列方式處理檢體:
1. 1份樣本體積與4份RNA Keeper Tissue Stabilizer 均質混合,可穩定保存於4度C一周內。
2. 血液樣本以3倍體積加入RBC Lysis Buffer。